处理离职后多付3000元工资时，以下特殊情况会影响处理结果：
1、劳动合同有特殊约定。若合同明确约定离职时可依工作表现支付奖励金、补偿金等，且多付的3000元符合约定条件和金额，该款项可能被认定为约定报酬，用人单位要求返还可能不被支持，需按合同执行。
2、用人单位有长期多付工资惯例。若用人单位长期向类似岗位员工多付工资，且离职员工有理由相信此次3000元是应得报酬，用人单位主张返还会较困难，需考虑员工合理信赖利益。
3、多付系系统故障或财务过失且员工善意取得。若因工资系统故障或财务人员失误多付，员工不知情且已善意消费，用人单位全额追讨可能受限，需平衡双方利益，员工可在合理范围内返还。
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离职后多付3000元工资本身不违法，但需结合具体情形判断：
多付工资是否违法，取决于是否符合劳动合同和公司政策约定。
若双方自愿且符合公司薪酬政策，多付工资属公司自主经营管理的薪酬调整，不构成违法。
若未按合同或规定无正当理由多付3000元，虽支付行为不违法，但可能引发奖金、补贴等性质争议，进而涉及税务、社保等合规问题。
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离职后多付3000元工资虽支付行为合法，但可能给用人单位带来法律风险：
1、员工拒绝返还风险：用人单位要求员工返还多付工资，员工若主张为自愿支付的奖金、补贴等，且用人单位无法举证证明系多付工资，可能无法追回该3000元。
2、税务和社保合规风险：若多付工资未依规申报个税或导致社保缴费基数错误，用人单位将面临税务处罚、社保稽核，需补缴税款、滞纳金及可能的罚款。
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离职后多付3000元工资是否违法，需依据法律法规判断：
《中华人民共和国民法典》《中华人民共和国劳动合同法》等未禁止用人单位多付工资。多付工资属用人单位对自身财产的处分，只要是真实意思表示，不违反法律强制性规定和公序良俗，即为合法。就离职后多付3000元而言，只要用人单位基于真实意愿支付（非受欺诈、胁迫），支付行为不违法。但多付工资涉及税务申报、社保缴费基数确定时，需遵守《中华人民共和国税收征收管理法》《社会保险法》等规定，确保合规，这并不影响多付工资行为本身的合法性。

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